RNA解析パイプラインschemes

_images/rna_workflow.png
Inputの方法は
[fastq]の1種類です.sample confで定義します.
記載方法は Sample_confの書き方 をみてください.
Fustion検出が実行されます.

Fusion検出

task_star_align:
 starによるリファレンスゲノムにアライメントを実行します.
task_fusion_fusion:
 fusionを検出します.

その他、個別で機能するTask

link_input_fastq:
 project root directory内にFASTQファイルをリンクします.