RNA 解析で出力されるファイルについて

出力ディレクトリ階層

_images/rna_tree.png

マッピング結果(BAMファイル)

{出力ルートディレクトリ}/star/{サンプル名}ディレクトリ内に出力されます.
  • {サンプル名}.Aligned.sortedByCoord.out.bam – BAMファイル.
  • {サンプル名}.Aligned.sortedByCoord.out.bam.bai – BAM indexファイル.

Fusion検出結果

{出力ルートディレクトリ}/fusion/{サンプル名}ディレクトリ内に出力されます.
  • {サンプル名}_fusion_fusion.result.txt – 融合遺伝子検出結果ファイル.
  • {サンプル名}_star.fusion.result.txt – 中間ファイル.デバッグ用.

config log script

実行時のパラメータやツールの設定情報,log,使用したScriptが保存されます.