RNA サンプル設定ファイルのについて¶
項目は1種類です.
[fastq] | FASTQファイルを入力として解析します |
RNA解析では[fastq]のみ指定します.FASTQファイルを指定しGenomonを実行するだけで融合遺伝子検出結果が出力されます.
[fastq]の記載方法¶
項目[fastq]には入力FASTQファイルのパスを記載します.
# サンプル名,ペアリードの1つ目のFASTQ,ペアリードの2つ目のFASTQ と記載します(カンマ区切りです)
sample1_tumor,/home/genomon/sample1_T_read1.fastq,/home/genomon/sample1_T_read2.fastq
sample1_normal,/home/genomon/sample1_N_read1.fastq,/home/genomon/sample1_N_read2.fastq
サンプル名は任意で指定してください.ディレクトリやファイル名で使用されます.